第1話　本編

パイロットとして新しい人生を歩み始めた南光太郎の前に、人類の抹殺を目論む異次元の侵略者・クライシス帝国が現れる。彼らは仮面ライダーブラックである光太郎を仲間にしようとたくらむが失敗。そして、変身能力を壊された光太郎は宇宙に放り出され…。