第1話　本編

1988年に第1作がOVAとして発表されて以降、アニメやコミックなどメディアミックス展開で人気を博した「機動警察パトレイバー」を初めて実写化した「THE NEXT GENERATION パトレイバー」から、ドラマシリーズの第4話と第5話を映画館で先行上映する劇場上映版第3章。特車二課の泉野明は、買い出しに来たコンビニでテロリストに捕らわれ、人質になってしまう。籠城を決め込む犯人との奇妙な交流も生まれる中、後藤田隊長の秘策でカーシャとイングラムが動き出す（エピソード4「野良犬たちの午後」）。熱海に慰安旅行に来ていた特車二課は、相次ぐサーファー失踪事件と怪獣と思しき巨大生物出現によって引き起こされた騒動に巻き込まれてしまう。騒ぎに乗じて怪しい科学者や預言者も現れて……（エピソード5「大怪獣現わる　前編」）。「大怪獣現わる」は、総監督の押井守が自らメガホンをとったエピソード。