第1話　本編

数々の仲間の死、響との離別を経て、人類最後の希望の都市・ユートピアの内部に辿り着いた明日葉（玉城ティナ）と佳奈恵（飯豊まりえ）、加州（溝端淳平）、海斗（前田公輝）、ゆら（佐野ひなこ）ら生存者たち。ユートピアの2本ある塔のうちの一つ「研究タワー」は、劇場版で響と子供のミライ、そしてワクチンを巡る闘いが描かれた。一方、Season5の舞台となるもう一つのタワーでは、政治家らが集結し、法の整備や秩序を作りながら、かつての文明を取り戻そうと奮闘していた。

そんなタワーに辿り着いた明日葉と佳奈恵らを待ち受けていたのは、ユートピア現代表の息子で明日葉の元婚約者の冬馬（柿澤勇人）。冬馬の案内で、明日葉とゆらは上層階の『タワー』へ、その他の者は地下の『アンダー』へと導かれる。そこで生存者たちが目にしたのは、人間の価値によって二分されるという、絶対的な上下世界――。理想郷とはかけ離れた世界で『タ...