第1話　本編

3年の沈黙を破って新たに制作された、「デジモン」のTVアニメスペシャル。デジタルワールドを統べるホストコンピュータ・イグドラシル。それが発動させたXプログラムとは、新たな世界を構築するために彼の地に暮らすデジモンたちを全てデリートすることだった。それに抗うレジスタンスたちと、イグドラシルに仕えるロイヤルナイツとの間に抗争が勃発する中、X抗体を体内に秘めたドルモンが姿を現す。その存在はこの戦いをどう左右するのだろうか？　以前のように人間キャラが登場せず、全編をフル3DCGで描写しているのが本作の新たな特徴だ。前期「デジモン」シリーズのシリーズディレクターだった角銅博之が監督を務めていることもあってか、各デジモンの配役は旧作に忠実だった。