第1話　本編

ひろしとみさえのもとに「しんのすけ」が誕生して5年。嵐のような平和な日々を過ごしていたが、ある日、屁祖隠ちよめと名乗る女性が野原家を訪れる。 「私、しんのすけくんの本当の母親なんです」傍らには5才の少年、名は珍蔵。 突然の事に戸惑いながらも、追い返すわけにもいかず、2人を泊めることに。 しかし、その夜、突如謎の忍者軍団が襲い掛かる！ちよめはなんと、忍者の里を抜け出して追われているくノ一だった！ そしてその息子として、しんのすけもさらわれてしまう…。