第1話　本編

西暦2015年。人類を襲う謎の兵器「使徒」に対抗するため、汎用人型決戦兵器エヴァンゲリオンを完成させた特務機関ネルフは、14歳の少年少女達をパイロットにエヴァを実戦投入する。しかしその後ろでは同時に「人類補完計画」が進行していた……。95年10月よりＴＶ放映され、大きな反響を呼んだアニメシリーズの劇場版。本作は多くの謎を残したまま終了したＴＶ版の総集編と最終話という事だったが、制作が遅れに遅れ、その結末は本当の完結編、「新世紀エヴァンゲリオン劇場版　ＤＥＡＴＨ（ＴＲＵＥ）／Ａｉｒ／まごころを、君に」で描かれた。