第1話　本編

松本零士作品の原点となる壮大な海洋アクションストーリーが、「宇宙戦艦ヤマト」のメインライター・藤川桂介の手により、完全新作アニメとなって蘇る！――西暦２０ＸＸ年、日本海溝付近では謎の海難事故が続発。政府からの要請で事故に関与した疑いのある「海洋帝国」を極秘に調査することになった沖海洋研究所の所長・沖重造と副所長・沖五郎。しかし調査中、謎の潜水艦からの攻撃を受けふたりは行方不明になってしまう。出発の直前、ふたりから「９９」と刻み込まれた鍵を受け取った重造の孫で五郎の弟・沖進は深い悲しみの中で真相を突き止める決意をするのだが…。 JAN:9999200296825