第1話　本編

第1話「出口のない戦い」（原題：No Man's Land）レイス側の裏切りにより、彼らを人間にする作戦は失敗に終わった。母船は、レトロウィルスを仕掛けるために乗り込んでいたマッケイとロノンを乗せたまま、ハイパースペースに突入。シェパードもそれを追いかける……。一方、地球からの呼び出しを受けたウィアーは、今回の作戦の責任を問われるのだった。第2話「レイス人間」（原題：Misbegotten）シェパードたちは、母船を奪取して帰還した。しかし、引き連れてきたレイスたちの処遇が問題となる。レイスは人間化しているものの、ウィルスの効果は未知数。アトランティスに置いておくわけにもいかず、結局、別の惑星に移すことになった。医師としての責任を感じたベケットは、惑星にひとり残って経過を観察する。第3話「愛される男」（原題：Irresistible）とある小さな村で、シェパードたちはルシアスという男に...